公司扣除其三天工资是否公平？

不公平。依据《中华人民共和国劳动法》，用人单位应足额支付劳动报酬，离职时应结清工资。扣除三天工资无法律依据，可能引发劳动纠纷，损害公司声誉。
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处理方式有协商、投诉、仲裁。首选与公司协商，无果则向劳动监察部门投诉，仍无法解决可申请劳动仲裁，根据仲裁结果决定后续行动。
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不公平。处理方式：1.与公司协商，要求合理解释扣款原因并补发工资；2.若协商无果，收集证据向劳动监察大队投诉；3.投诉未解决，申请劳动仲裁，提交证据材料，等待裁决。